Eufemaino Fuentes kreeg zijn bekendheid door Operation Puerto. In 2006 liep hij tegen de lamp en werd hij opgepakt vanwege zijn betrokkenheid bij een omvangrijke dopingzaak. Eind april 2013 werd hij veroordeeld voor het in gevaar brengen van de volksgezondheid (Doping was niet strafbaar in Spanje)
Fuentes was zelf een 400 meter atleet en kreeg begeleiding van Manuel Pascua (broer van de trainer van Oscar Pereiro Sio) en Guillermo Laig, een Argentijnse dokter bekend vanwege gebruik van anabolen. Fuentes studeert geneeskunde met afstudeerrichting gynaecologie. Hij treedt daarna direct in dienst bij de Spaanse atletiekunie met dank aan Pascua. In 1984 werd hij hoofd van de medische commissie van de Spaanse atletiekbond.
Hij ging ook werken voor de wielerploeg Seat-Orbea met onder meer Pedro Delgado. Delgado werd in de Tour betrapt op het maskeermiddel ‘probenecide’, maar werd niet geschorst omdat het middel nog niet op de dopinglijst stond. Fuentes moest in 1988 ontslag bij de atletiekfederatie, vanwege het positief testen van Cristina Perez. Perez was hordenloopster en bovendien de (toekomstige) vrouw van Fuentes. Fuentes gaat zich in die tijd specialiseren in bloedtransfusies en
Begin jaren ’90 wordt Fuentes dokter van ONCE, de ploeg van Manolo Saiz. Fuentes was jarenlang de dokter van ONCE, samen met onder andere Del Moral en Terrados. Hij boekt direct succes met de Vuelta overwinning van Melcior Mauri. In 1992 is hij bovendien betrokken bij het atletiekgoud van Cacho op de 1500 meter, en waarschijnlijk diverse andere medailles. Hij in 1995 wordt ook arts bij de tweede klasse voetbalclub Elche CF. In 1998 stapt hij van ONCE over naar Kelme om daar de teamarts te worden. In 2001 komt Las Palmas in opspraak omdat er diverse spuiten en andere middelen in de kleedkamer worden gevonden. Ook daar is Fuentes bij betrokken.
In 2004 stopt hij bij Kelme en begeleid Liberty Seguros, de opvolger van ONCE. Niet veel later zal Fuentes opgepakt te worden voor een omvangrijke dopinghandel.
Fuentes wordt ook in verband gebracht met diverse voetbalclubs. Zo zouden Barcelona, Real Madrid, Real Sociedad, Betis Sevilla gebruik maken van de diensten van Fuentes. Hij werd in 2010 – ruim na het dopingschandaal – wederom ingehuurd door de Spaanse voetbalclub Las Palmas. Daarnaast zouden ook tennissers en basketballers betrokken zijn.
Fuentes werd in de rechtszaak schuldig bevonden aan het in gevaar brengen van de volksgezondheid en kreeg een gevangenisstraf van 1 jaar. Ook mag hij 4 jaar niet als sportarts werkzaam zijn en moest hij een boete van 4500 euro betalen. Alle bloedzakken aan bewijs dienen op last van de rechter te worden vernietigd. De vertaling van de gehele uitspraak vindt u hier. De overige beklaagden waaronder Once-baas Manolo Saiz werd vrijgesproken.